Museet rummer en omfattende samling af musikinstrumenter fra Europa, Asien og Afrika fra perioden ca. 1500-1900. Dertil kommer en række folkemusikinstrumenter fra 1900-tallet samt prøver på nodeskrift og udnyttelse af musikken i billedkunsten.
Den permanente udstilling af instrumenter er opdelt i to: Rum 2-13 med temaudstillinger om bl.a. violinbyggerværksted og messing-blæseinstrumenter - fra skabelon til færdigt instrument - komponistens "værktøjer", nodeskriftens udvikling samt mekaniske musikinstrumenter, og rum 14-29, hvor udstillingen former sig som en historisk vandring gennem Europas instrumentverden fra omkring år 1000 til begyndelsen af 1900-tallet.
I dag består museets samling af omkring 3.800 musikinstrumenter fra hele verden, hvoraf ca. 1.000 kan ses i udstillingen.